سری کمیک کتاب سونیک جوجه تیغی (Sonic the Hedgehog) اثر ایان فلین، داستان جوجه تیغی با سرعت صوت را دنبال می‌کند که در پی خراب کردن نقشه‌های شوم دانشمند دیوانه، دکتر اگمن است و همیشه هم در این کار موفق می‌شود و جلوی او را برای تبدیل کردن موجودات دنیا به برده‌های روباتی می‌گیرد.

بعد از حوادث قسمت قبل، سونیک به نزدیک‌ترین محله می‌رود تا به دوست قدیمی خود ایمی رز، برای کمک به مردم جنگ‌زده ملحق شود. ولی هر لحظه سونیک به ریشه‌ی این حمله‌های ناگهانی و کنترل نشده‌ی روبات‌های باقی مانده‌ی اگمن نزدیک می‌شود.