مبارزه با آفات و بیماریهای گردو به علت بزرگ بودن این درخت مشکل است زیرا سمپاشی تمام درخت به سختی انجام می شود. کاشت درختان پیوندی، استفاده از پایه های پا کوتاه، ترییت و هرس و انتخاب ارقامی که بطور جانبی محصول می دهند موجب کاهش اندازه درخت شده و بطور محسوسی سمپاشی و برداشت میوه را آسانتر می کند. تدابیر بهداشتی تاثیر زیادی در کنترل آفات و بیماری ها دارد ولی اغلب این تدابیر فراموش می شوند. تدابیر بهداشتی شامل کاشت درختان سالم جلوگیری از انتقال آفات و بیماریها از طریق ادوات هرس و سایر وسایل کاشت، هرس برگ ها وشاخه های بیمار و سوزاندن آنها است. نهال ها همچنین قبل از کاشت باید در نهالستان از نظر آفات و بیماری ها بررسی شوند.